Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strn4P58404 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strn4P58404 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn4P58404 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn4P58404 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn4P58404 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn4P58404 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn4P58404 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strn4P58404 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strn4P58404 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn4P58404 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strn4P58404 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strn4P58404 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn4P58404 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn4P58404 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strn4P58404 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms