Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FusP56959 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FusP56959 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FusP56959 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FusP56959 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FusP56959 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FusP56959 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FusP56959 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FusP56959 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FusP56959 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FusP56959 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FusP56959 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FusP56959 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FusP56959 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FusP56959 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FusP56959 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FusP56959 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FusP56959 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FusP56959 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FusP56959 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FusP56959 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FusP56959 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FusP56959 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FusP56959 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FusP56959 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FusP56959 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FusP56959 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FusP56959 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms