Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CckbrP56481 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CckbrP56481 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms