Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defb1P56386 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb1P56386 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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