Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab4aP56371 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms