Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp1P55194 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp1P55194 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms