Protein–RNA interactions for Protein: P55105

Bmp8b, Bone morphogenetic protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp8bP55105 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bmp8bP55105 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bmp8bP55105 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms