Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtskP55097 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtskP55097 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtskP55097 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtskP55097 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtskP55097 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CtskP55097 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CtskP55097 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtskP55097 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtskP55097 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtskP55097 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtskP55097 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CtskP55097 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtskP55097 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtskP55097 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtskP55097 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtskP55097 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtskP55097 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtskP55097 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtskP55097 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtskP55097 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtskP55097 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtskP55097 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtskP55097 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtskP55097 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtskP55097 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtskP55097 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtskP55097 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtskP55097 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtskP55097 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtskP55097 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtskP55097 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtskP55097 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtskP55097 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtskP55097 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtskP55097 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtskP55097 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtskP55097 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtskP55097 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CtskP55097 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtskP55097 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtskP55097 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtskP55097 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtskP55097 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtskP55097 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtskP55097 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtskP55097 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtskP55097 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtskP55097 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtskP55097 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CtskP55097 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtskP55097 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtskP55097 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CtskP55097 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtskP55097 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtskP55097 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtskP55097 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtskP55097 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtskP55097 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtskP55097 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtskP55097 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtskP55097 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtskP55097 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtskP55097 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtskP55097 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtskP55097 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtskP55097 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtskP55097 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CtskP55097 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CtskP55097 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtskP55097 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtskP55097 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms