Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn5P54830 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn5P54830 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms