Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Faf1P54731 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Faf1P54731 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Faf1P54731 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Faf1P54731 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms