Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad23aP54726 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad23aP54726 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad23aP54726 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms