Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacnb3P54285 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacnb3P54285 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms