Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PitpnbP53811 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PitpnbP53811 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms