Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PctpP53808 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PctpP53808 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PctpP53808 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PctpP53808 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PctpP53808 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PctpP53808 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PctpP53808 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PctpP53808 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PctpP53808 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PctpP53808 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PctpP53808 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PctpP53808 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PctpP53808 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PctpP53808 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PctpP53808 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PctpP53808 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PctpP53808 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PctpP53808 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PctpP53808 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PctpP53808 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PctpP53808 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PctpP53808 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PctpP53808 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PctpP53808 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PctpP53808 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PctpP53808 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PctpP53808 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PctpP53808 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PctpP53808 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PctpP53808 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PctpP53808 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PctpP53808 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PctpP53808 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PctpP53808 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PctpP53808 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PctpP53808 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PctpP53808 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PctpP53808 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PctpP53808 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PctpP53808 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PctpP53808 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PctpP53808 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PctpP53808 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PctpP53808 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PctpP53808 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PctpP53808 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PctpP53808 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PctpP53808 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PctpP53808 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PctpP53808 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PctpP53808 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PctpP53808 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PctpP53808 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PctpP53808 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PctpP53808 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PctpP53808 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PctpP53808 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 594 ms