Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RabggtbP53612 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RabggtbP53612 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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