Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efnb1P52795 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Efnb1P52795 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms