Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr1cP52432 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms