Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CntfP51642 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfP51642 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfP51642 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfP51642 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfP51642 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfP51642 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfP51642 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfP51642 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfP51642 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfP51642 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfP51642 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CntfP51642 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CntfP51642 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CntfP51642 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CntfP51642 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CntfP51642 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CntfP51642 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CntfP51642 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CntfP51642 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CntfP51642 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CntfP51642 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfP51642 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfP51642 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfP51642 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfP51642 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfP51642 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfP51642 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfP51642 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfP51642 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfP51642 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfP51642 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CntfP51642 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfP51642 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfP51642 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfP51642 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfP51642 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfP51642 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfP51642 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfP51642 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfP51642 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfP51642 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CntfP51642 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CntfP51642 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CntfP51642 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CntfP51642 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CntfP51642 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CntfP51642 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CntfP51642 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CntfP51642 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CntfP51642 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CntfP51642 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms