Protein–RNA interactions for Protein: P50992

Atp4b, Potassium-transporting ATPase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4bP50992 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp4bP50992 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp4bP50992 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp4bP50992 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp4bP50992 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp4bP50992 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp4bP50992 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp4bP50992 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp4bP50992 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp4bP50992 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp4bP50992 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms