Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc13P50207 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc13P50207 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms