Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpreP49446 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtpreP49446 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtpreP49446 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtpreP49446 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpreP49446 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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