Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ercc3P49135 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ercc3P49135 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms