Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atoh1P48985 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atoh1P48985 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atoh1P48985 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms