Protein–RNA interactions for Protein: P48776

Tdo2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdo2P48776 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdo2P48776 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdo2P48776 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdo2P48776 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms