Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptx3P48759 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptx3P48759 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms