Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca1P48754 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brca1P48754 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brca1P48754 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brca1P48754 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brca1P48754 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brca1P48754 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brca1P48754 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brca1P48754 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brca1P48754 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms