Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rfx2P48379 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rfx2P48379 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms