Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VdrP48281 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VdrP48281 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VdrP48281 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VdrP48281 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VdrP48281 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VdrP48281 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VdrP48281 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VdrP48281 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VdrP48281 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VdrP48281 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VdrP48281 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VdrP48281 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VdrP48281 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VdrP48281 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VdrP48281 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VdrP48281 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VdrP48281 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VdrP48281 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VdrP48281 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VdrP48281 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VdrP48281 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VdrP48281 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VdrP48281 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VdrP48281 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VdrP48281 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VdrP48281 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VdrP48281 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VdrP48281 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VdrP48281 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VdrP48281 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VdrP48281 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VdrP48281 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VdrP48281 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VdrP48281 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VdrP48281 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VdrP48281 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VdrP48281 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VdrP48281 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VdrP48281 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VdrP48281 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VdrP48281 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VdrP48281 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VdrP48281 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VdrP48281 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VdrP48281 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VdrP48281 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VdrP48281 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VdrP48281 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VdrP48281 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VdrP48281 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VdrP48281 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VdrP48281 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VdrP48281 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VdrP48281 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VdrP48281 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VdrP48281 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VdrP48281 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VdrP48281 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VdrP48281 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VdrP48281 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VdrP48281 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VdrP48281 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VdrP48281 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VdrP48281 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VdrP48281 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VdrP48281 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VdrP48281 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VdrP48281 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VdrP48281 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VdrP48281 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VdrP48281 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VdrP48281 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VdrP48281 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VdrP48281 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VdrP48281 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VdrP48281 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VdrP48281 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VdrP48281 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VdrP48281 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VdrP48281 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VdrP48281 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VdrP48281 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VdrP48281 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VdrP48281 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VdrP48281 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VdrP48281 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VdrP48281 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VdrP48281 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VdrP48281 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VdrP48281 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VdrP48281 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VdrP48281 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VdrP48281 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VdrP48281 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VdrP48281 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VdrP48281 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VdrP48281 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VdrP48281 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VdrP48281 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms