Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl29P47915 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl29P47915 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms