Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp2P46686 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tulp2P46686 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp2P46686 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp2P46686 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp2P46686 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp2P46686 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp2P46686 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp2P46686 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp2P46686 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp2P46686 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tulp2P46686 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp2P46686 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp2P46686 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp2P46686 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp2P46686 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp2P46686 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp2P46686 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp2P46686 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp2P46686 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp2P46686 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp2P46686 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp2P46686 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp2P46686 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp2P46686 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp2P46686 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp2P46686 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp2P46686 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp2P46686 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp2P46686 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp2P46686 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp2P46686 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp2P46686 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp2P46686 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp2P46686 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp2P46686 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp2P46686 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp2P46686 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms