Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgavP43406 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ItgavP43406 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgavP43406 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgavP43406 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgavP43406 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgavP43406 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgavP43406 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgavP43406 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.9 ms