Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Chd1P40201 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chd1P40201 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chd1P40201 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Chd1P40201 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd1P40201 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
Chd1P40201 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chd1P40201 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chd1P40201 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chd1P40201 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chd1P40201 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd1P40201 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chd1P40201 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd1P40201 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd1P40201 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd1P40201 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms