Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grik2P39087 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik2P39087 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik2P39087 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik2P39087 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grik2P39087 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik2P39087 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grik2P39087 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik2P39087 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms