Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddit3P35639 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddit3P35639 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms