Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TpoP35419 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TpoP35419 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TpoP35419 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TpoP35419 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TpoP35419 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TpoP35419 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TpoP35419 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TpoP35419 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TpoP35419 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TpoP35419 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TpoP35419 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TpoP35419 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TpoP35419 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TpoP35419 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TpoP35419 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TpoP35419 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TpoP35419 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TpoP35419 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TpoP35419 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TpoP35419 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TpoP35419 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TpoP35419 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TpoP35419 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TpoP35419 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TpoP35419 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TpoP35419 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TpoP35419 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TpoP35419 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TpoP35419 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TpoP35419 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TpoP35419 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TpoP35419 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TpoP35419 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TpoP35419 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TpoP35419 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TpoP35419 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TpoP35419 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TpoP35419 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TpoP35419 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TpoP35419 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TpoP35419 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TpoP35419 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TpoP35419 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TpoP35419 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TpoP35419 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TpoP35419 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TpoP35419 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TpoP35419 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TpoP35419 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TpoP35419 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TpoP35419 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TpoP35419 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TpoP35419 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TpoP35419 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TpoP35419 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TpoP35419 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TpoP35419 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TpoP35419 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms