Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoc1P34928 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms