Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pola1P33609 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pola1P33609 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pola1P33609 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pola1P33609 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Pola1P33609 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pola1P33609 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pola1P33609 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pola1P33609 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pola1P33609 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pola1P33609 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pola1P33609 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pola1P33609 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms