Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms