Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hoxa11P31311 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms