Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa2P31245 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa2P31245 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms