Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdk4P30285 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk4P30285 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk4P30285 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk4P30285 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk4P30285 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk4P30285 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk4P30285 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk4P30285 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk4P30285 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk4P30285 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk4P30285 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk4P30285 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk4P30285 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk4P30285 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk4P30285 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms