Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vcam1P29533 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vcam1P29533 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vcam1P29533 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms