Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mep1aP28825 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mep1aP28825 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms