Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb3P28231 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb3P28231 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb3P28231 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms