Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabrg3P27681 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabrg3P27681 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabrg3P27681 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms