Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Twist1P26687 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Twist1P26687 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Twist1P26687 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Twist1P26687 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Twist1P26687 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Twist1P26687 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Twist1P26687 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Twist1P26687 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Twist1P26687 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Twist1P26687 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Twist1P26687 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Twist1P26687 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Twist1P26687 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Twist1P26687 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Twist1P26687 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Twist1P26687 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Twist1P26687 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Twist1P26687 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Twist1P26687 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Twist1P26687 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Twist1P26687 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Twist1P26687 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Twist1P26687 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Twist1P26687 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Twist1P26687 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Twist1P26687 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Twist1P26687 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Twist1P26687 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Twist1P26687 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Twist1P26687 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Twist1P26687 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Twist1P26687 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Twist1P26687 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Twist1P26687 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Twist1P26687 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms