Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PdgfraP26618 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfraP26618 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfraP26618 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms