Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af2P26369 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af2P26369 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af2P26369 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af2P26369 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af2P26369 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af2P26369 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2af2P26369 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2af2P26369 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af2P26369 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms