Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnna1P26231 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnna1P26231 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnna1P26231 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms