Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra3P26049 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra3P26049 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms